El auto-ensamblaje puede catalogarse como un proceso "convergente," ya que un numero definido de partes se acoplan con el fin de obtener una determinada estructura. Es por esto que se pueden identificar dos caracteristicas importantes. Primero, un auto-ensamblaje eficiente ocurre cuando hay un reconocimiento firme de todos los componentes tanto geometrica como espacialmente. Segundo, luego del proceso de ensamblaje todos los sitios posibles de union tanto en el hospedero como en el huesped, deben quedar "ocupados o ensamblados" con el fin de evitar la formacion de otro tipo de estructuras diferentes a la que se prediseno en un inicio. Estos procesos han sido cruciales durante el desarrollo de organismos vivos y su evolucion. Tan solo que ahora, el hombre puede tener acceso a ellos de una manera muy controlada e intenta crear nuevas entidades moleculares con diversas aplicaciones. Por citar algunos ejemplos vistos en la naturaleza, tenemos: el plegamiento natural de las proteinas para adquirir una funcion biologica, el ensamblaje de los virus durante su reproduccion al interior del organismo infectado y la formacion de micelas en diversos disolventes a partir de tensoactivos."
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